Aline PROBST
Chef d'équipe
PROBST
Aline
Chef d'équipe
DR
Présentation
Directrice de Recherche, CNRS, depuis 2018
Cheffe d'équipe au iGReD, depuis 2013
Chargée de Recherche, CNRS, 2009-13
Post-doctorante, Institut Curie, Paris, 2005-09, équipe G. Almouzni
Ph.D, Friedrich Miescher Institute, Bâle, Suisse, 2001-04, équipe J. Paszkowski
Publications
Biom3d, a modular framework to host and develop 3D segmentation methods
Publié le 25 Juil 2024
Mougeot G , Safarbati S , Alégot H , Pouchin P , Field N, Almagro S, Pery E, Probst AV , Tatout C , Evans DE, Graumann K, Chausse F, Desset S
The TELOMERE REPEAT BINDING proteins TRB4 and TRB5 function as transcriptional activators of PRC2-controlled genes to regulate plant development.
Publié le 01 Avr 2024 dans Plant communications - pp 100890
Amiard S , Feit L , Vanrobays E , Simon L , Le Goff S , Loizeau L , Wolff L, Butter F, Bourbousse C, Barneche F, Tatout C , Probst AV
HSFA1a modulates plant heat stress responses and alters the 3D chromatin organization of enhancer-promoter interactions
Publié le 28 Jan 2023 dans Nat. Comm. , vol. 14 - pp 469
Huang Y, An J, Sircar S, Bergis C, Lopes CD, He X, Da Costa B, Tan FQ, Bazin J, Antunez-Sanchez J, Mammarella MF, Devani RS, Brik-Chaouche R, Bendahmane A, Frugier F, Xia C, Rothan C, Probst AV , Mohamed Z, Bergounioux C, Delarue M, Zhang Y, Zheng S, Crespi M, Fragkostefanakis S, Mahfouz MM, Ariel F, Gutierrez-Marcos J, Raynaud C, Latrasse D, Benhamed M
Evolutionarily conserved protein motifs drive interactions between the plant nucleoskeleton and nuclear pores
Publié le 21 Sep 2023 dans The Plant Cell
Mermet S , Voisin M , Mordier J , Dubos T , Tutois S , Tuffery P, Baroux C, Tamura K, Probst AV , Vanrobays E , Tatout C
Histone H1 protects telomeric repeats from H3K27me3 invasion in Arabidopsis
Publié le 28 Juil 2023 dans Cell Reports , vol. 42 - pp 112894
Teano G, Concia L, Wolff L, Carron L, Biocanin I, Adamusová K, Miloslava Fojtová, Michael Bourge, Amira Kramdi, Vincent Colot, Ueli Grossniklaus, Bowler C, Baroux C, Carbone A, Probst AV , Procházková Schrumpfová P, Fajkus J, Amiard S , Grob S, Bourbousse C, Barneche F
Maintenance and dynamic reprogramming of chromatin organization during development.
Publié le 26 Jan 2023 dans The Plant Journal , vol. 118 - pp 657-670
Deposition and eviction of histone variants define functional chromatin states in plants.
Publié le 30 Oct 2022 dans Current opinion in plant biology , vol. 69 - pp 102266
Histone H1 protects telomeric repeats from H3K27me3 invasion in Arabidopsis
Publié le 06 Déc 2022 dans bioRxiv
Teano G, Concia L, Wolff L, Carron L, Biocanin I, Adamusová K, Fojtová M, Bourge M, Kramdi A, Colot V, Grossniklaus U, Bowler C, Baroux C, Carbone A, Probst AV , Procházková Schrumpfová P, Fajkus J, Amiard S , Grob S, Bourbousse C, Barneche F
Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gene coregulation in Arabidopsis.
Publié le 03 Juin 2021 dans Genome research , vol. 31 - pp 1230-44
Huang Y, Sicar S, Ramirez-Prado JS, Manza-Mianza D, Antunez-Sanchez J, Brik-Chaouche R, Rodriguez-Granados NY, An J, Bergounioux C, Mahfouz MM, Hirt H, Crespi M, Concia L, Barneche F, Amiard S , Probst AV , Gutierrez-Marcos J, Ariel F, Raynaud C, Latrasse D, Benhamed M
The Histone Chaperone HIRA Is a Positive Regulator of Seed Germination.
Publié le 14 Avr 2021 dans International journal of molecular sciences , vol. 22
Layat E , Bourcy M, Cotterell S , Zdzieszyńska J, Desset S , Duc C , Tatout C , Bailly C, Probst AV
Automated 3D bio-imaging analysis of nuclear organization by NucleusJ 2.0.
Publié le 30 Déc 2020 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 11 - pp 315-329
Dubos T , Poulet A , Gonthier-Gueret C, Mougeot G , Vanrobays E , Li Y , Tutois S , Pery E, Chausse F, Probst AV , Tatout C , Desset S
Untangling chromatin interactions.
Publié le 17 Août 2020 dans Journal of experimental botany , vol. 71 - pp 5115-5118
Similar yet critically different: the distribution, dynamics and function of histone variants.
Publié le 17 Août 2020 dans Journal of experimental botany , vol. 71 - pp 5191-5204
Probst AV , Desvoyes B, Gutierrez C
The H3 histone chaperone NASP(SIM3) escorts CenH3 in Arabidopsis.
Publié le 30 Jan 2020 dans The Plant Journal , vol. 101 - pp 71-86
Le Goff S , Keçeli BN, Jeřábková H, Heckmann S, Rutten T, Cotterell S , Schubert V, Roitinger E, Mechtler K, Franklin FCH, Tatout C , Houben A, Geelen D, Probst AV , Lermontova I
Looking At the Past and Heading to the Future: Meeting Summary of the 6(th) European Workshop on Plant Chromatin 2019 in Cologne, Germany.
Publié le 07 Fév 2019 dans Frontiers in plant science , vol. 10 - pp 1795
Moreno-Romero J, Probst AV , Trindade I, Kalyanikrishna, Engelhorn J, Farrona S
Replication-coupled histone H3.1 deposition determines nucleosome composition and heterochromatin dynamics during Arabidopsis seedling development.
Publié le 30 Jan 2019 dans The New phytologist , vol. 221 - pp 385-398
Benoit M , Simon L , Desset S , Duc C , Cotterell S , Poulet A , Le Goff S , Tatout C , Probst AV
High-Affinity LNA-DNA Mixmer Probes for Detection of Chromosome-Specific Polymorphisms of 5S rDNA Repeats in Arabidopsis thaliana.
Publié le 01 Jan 2018 dans Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) , vol. 1675 - pp 481-491
A Compendium of Methods to Analyze the Spatial Organization of Plant Chromatin.
Publié le 01 Jan 2018 dans Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) , vol. 1675 - pp 397-418
Meeting report – INDEPTH kick-off meeting.
Publié le 25 Juin 2018 dans Journal of cell science , vol. 131
Arabidopsis ATRX Modulates H3.3 Occupancy and Fine-Tunes Gene Expression.
Publié le 30 Juil 2017 dans The Plant cell , vol. 29 - pp 1773-1793
Duc C , Benoit M , Détourné G , Simon L , Poulet A , Jung M, Veluchamy A, Latrasse D, Le Goff S , Cotterell S , Tatout C , Benhamed M, Probst AV
The LINC complex contributes to heterochromatin organisation and transcriptional gene silencing in plants.
Publié le 01 Fév 2017 dans Journal of cell science , vol. 130 - pp 590-601
Poulet A , Duc C , Voisin M , Desset S , Tutois S , Vanrobays E , Benoit M , Evans DE, Probst AV , Tatout C
NucleusJ: an ImageJ plugin for quantifying 3D images of interphase nuclei.
Publié le 01 Avr 2015 dans Bioinformatics (Oxford, England) , vol. 31 - pp 1144-6
Poulet A , Arganda-Carreras I, Legland D, Probst AV , Andrey P, Tatout C
The histone chaperone complex HIR maintains nucleosome occupancy and counterbalances impaired histone deposition in CAF-1 complex mutants.
Publié le 30 Mar 2015 dans The Plant journal : for cell and molecular biology , vol. 81 - pp 707-22
Duc C , Benoit M , Le Goff S , Simon L , Poulet A , Cotterell S , Tatout C , Probst AV
Structure and Function of Centromeric and Pericentromeric Heterochromatin in Arabidopsis thaliana.
Publié le 30 Nov 2015 dans Frontiers in plant science , vol. 6 - pp 1049
Stress-induced structural changes in plant chromatin.
Publié le 30 Oct 2015 dans Current opinion in plant biology , vol. 27 - pp 8-16
Probst AV , Mittelsten Scheid O
Evolutionary history of Methyltransferase 1 genes in hexaploid wheat.
Publié le 23 Oct 2014 dans BMC genomics , vol. 15 - pp 922
Thomas M, Pingault L, Poulet A , Duarte J, Throude M, Faure S, Pichon JP, Paux E, Probst AV , Tatout C
Heterochromatin dynamics during developmental transitions in Arabidopsis – a focus on ribosomal DNA loci.
Publié le 15 Août 2013 dans Gene , vol. 526 - pp 39-45
Benoit M , Layat E , Tourmente S , Probst AV
Heterochromatin reorganization during early mouse development requires a single-stranded noncoding transcript.
Publié le 26 Sep 2013 dans Cell reports , vol. 4 - pp 1156-67
Casanova M, Pasternak M, El Marjou F, Le Baccon P, Probst AV , Almouzni G
Heterochromatin maintenance and establishment: lessons from the mouse pericentromere.
Publié le 01 Sep 2011 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 2 - pp 332-8
Almouzni G, Probst AV
Heterochromatin establishment in the context of genome-wide epigenetic reprogramming.
Publié le 30 Mai 2011 dans Trends in genetics : TIG , vol. 27 - pp 177-85
Probst AV , Almouzni G
Heterochromatin at mouse pericentromeres: a model for de novo heterochromatin formation and duplication during replication.
Publié le 01 Jan 2010 dans Cold Spring Harbor symposia on quantitative biology , vol. 75 - pp 155-65
Maison C, Quivy JP, Probst AV , Almouzni G
A strand-specific burst in transcription of pericentric satellites is required for chromocenter formation and early mouse development.
Publié le 19 Oct 2010 dans Developmental cell , vol. 19 - pp 625-38
Probst AV , Okamoto I, Casanova M, El Marjou F, Le Baccon P, Almouzni G
Pericentric heterochromatin: dynamic organization during early development in mammals.
Publié le 30 Jan 2008 dans Differentiation; research in biological diversity , vol. 76 - pp 15-23
Probst AV , Almouzni G
Functional genomic analysis of CAF-1 mutants in Arabidopsis thaliana.
Publié le 07 Avr 2006 dans The Journal of biological chemistry , vol. 281 - pp 9560-8
Schönrock N, Exner V, Probst A , Gruissem W, Hennig L
Epigenetic regulation of transcription in intermediate heterochromatin.
Publié le 30 Déc 2006 dans EMBO reports , vol. 7 - pp 1279-84
Habu Y, Mathieu O , Tariq M, Probst AV , Smathajitt C, Zhu T, Paszkowski J
CAF-1 is essential for heterochromatin organization in pluripotent embryonic cells.
Publié le 03 Nov 2006 dans PLoS genetics , vol. 2 - pp e181
Houlard M, Berlivet S, Probst AV , Quivy JP, Héry P, Almouzni G, Gérard M
Distinct regulation of histone H3 methylation at lysines 27 and 9 by CpG methylation in Arabidopsis.
Publié le 03 Août 2005 dans The EMBO journal , vol. 24 - pp 2783-91
Tandem repetitive transgenes and fluorescent chromatin tags alter local interphase chromosome arrangement in Arabidopsis thaliana.
Publié le 15 Août 2005 dans Journal of cell science , vol. 118 - pp 3751-8
Pecinka A, Kato N, Meister A, Probst AV , Schubert I, Lam E
BRU1, a novel link between responses to DNA damage and epigenetic gene silencing in Arabidopsis.
Publié le 01 Avr 2004 dans Genes & development , vol. 18 - pp 782-93
Takeda S, Tadele Z, Hofmann I, Probst AV , Angelis KJ, Kaya H, Araki T, Mengiste T, Mittelsten Scheid O, Shibahara K, Scheel D, Paszkowski J
Arabidopsis histone deacetylase HDA6 is required for maintenance of transcriptional gene silencing and determines nuclear organization of rDNA repeats.
Publié le 30 Avr 2004 dans The Plant cell , vol. 16 - pp 1021-34
Probst AV , Fagard M, Proux F, Mourrain P, Boutet S, Earley K, Lawrence RJ, Pikaard CS, Murfett J, Furner I, Vaucheret H, Mittelsten Scheid O
Chromatin techniques for plant cells.
Publié le 30 Sep 2004 dans The Plant journal : for cell and molecular biology , vol. 39 - pp 776-89
Bowler C, Benvenuto G, Laflamme P, Molino D, Probst AV , Tariq M, Paszkowski J
Two means of transcriptional reactivation within heterochromatin.
Publié le 02 Mar 2003 dans The Plant journal : for cell and molecular biology , vol. 33 - pp 743-9
Probst AV , Fransz PF, Paszkowski J, Mittelsten Scheid O
Erasure of CpG methylation in Arabidopsis alters patterns of histone H3 methylation in heterochromatin.
Publié le 22 Juil 2003 dans Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 100 - pp 8823-7
Tariq M, Saze H, Probst AV , Lichota J, Habu Y, Paszkowski J
Two regulatory levels of transcriptional gene silencing in Arabidopsis.
Publié le 15 Oct 2002 dans Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 99 - pp 13659-62
Mittelsten Scheid O, Probst AV , Afsar K, Paszkowski J
