Le personnel de la plateforme est chargé de conseiller, d’accompagner et de former les utilisateurs à l’utilisation autonome du matériel.

L’équipe de CLIC organise des réunions pour s’assurer de la faisabilité du projet, définir les conditions expérimentales (fluorophores, type de montage, contrôles) et le matériel à utiliser (autonomie après formation ou assistance). Ces réunions permettent également d’anticiper les besoins en analyse d’images, afin que le CLIC puisse définir les  méthodes d’imagerie et d’analyse les plus appropriées et former l’utilisateur si nécessaire.

Au début du projet, une session de test sur des échantillons est proposée afin de déterminer le meilleur microscope et les conditions d’acquisition optimales. Au cours du projet, des réunions de suivi sont proposées en fonction de l’évolution des besoins des utilisateurs.

OMERO, une solution de gestion de données, est proposée aux utilisateurs pour stocker leurs données d’images, soit en interne pour les utilisateurs de l’iGReD, soit sur la plateforme Auvergne Bio-informatique (AuBi) pour les utilisateurs externes.

CLIC propose une large gamme de microscopes avec différents modes d’acquisition pour améliorer la vitesse, la sensibilité et la résolution spatiale ou spectrale :

– Zeiss LSM 800 AiryScan

– Zeiss LSM 980 Airyscan 2 + module de détection spectrale

– Zeiss Cell Observer Spinning Disk (disque rotatif)

– Leica TCS SP5 Resonant Scanner

– Leica TCS SP8 Lightning Scanner Resonant Navigator

– Leica MMAF

– Feuille de lumière ZEISS LS7

Pour compléter l’utilisation des microscopes, la plate-forme dispose de 3 stations d’analyse d’images équipées d’une large gamme de logiciels spécialisés (Fiji, Icy, Qupath, Zen… , ARIVIS, 2 licences IMARIS).